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君子兰栽培三四年后，根茎周围容易产生分蘖，俗称“腋芽”，用君子兰的分蘖从母株上分割开来进行繁殖，一般可保持原品种特性，但有时也会产生突变，致使植株某一部分或某器官与原品种特性有明显的不同，如株型变矮，叶片变大、变短、叶色变多，花、种子不同等，这种现象叫做“芽变”。人们利用君子兰芽变这一特性，从中选择出优良君子兰新品种，称为“芽变选种”。君子兰较易产生芽变，芽变的类型多种多样，有的芽变从观赏的角度看是不利的，称为“劣变”。有的芽变符合人们的要求，称做“优变”，我们进行芽选就是要去劣选优。对广大君子兰爱好者来说，平时对君子兰进行细心观察，一旦发现优变苗芽，及时向专家或研究部门申报鉴定是较好的方法。腋芽长出时较易发现叶片的变异。在发生严重自然灾害后，也是发现抗某些自然灾害芽变的好时机。1999 年12月下旬，广东遭遇历史很罕见的冻害，较低温度达－4至－5度，很有可能从那些经受严寒考验而又未被冻死的君子兰植株中选育出抗寒芽变新品种。由于君子兰的生长条件发生了变化，往往也会引起君子兰的异常表现。因此，关键是在芽变选种过程中，要对一些变异现象做全面分析，认真区分是芽变还是环境因素导致的变异，前者是植株遗传物质变化，即真正的变异；后者则是由于环境条件或栽培管理上暂时变化而反映出来的。即使是真正的芽变，有的表现比较稳定，有的则表现不稳定，甚至几年后又恢复原状，变异消失。如发现突变株，要经过初选、鉴定、复选等步骤，逐步选育成新品种。具体做法是：当初步鉴定是真正的芽变时，应保护好植株，作好标记，记载变异情况、部位、特点等，于第二至第三年对初选芽进行复选，第四年进行决选。对特别优良的芽变品种，要尽快繁殖，以备将来推向市场，并进行命名。
